Деятельность таможенников на территории Колымы началась с 1989 года – с момента образования Магаданского таможенного поста с подчинением Петропавловск-Камчатской таможне. В 1991 году пост, насчитывавший в штате лишь шесть сотрудников, был реорганизован в Магаданскую таможню, подчинив ей и таможенный пост "Сокол" (ныне таможенный пост "Аэропорт Магадан") с пятью должностными лицами в штате, сообщили ИА MagadanMedia в пресс-службе Магаданской таможни.
В настоящее время в Магаданской таможне служит около 200 человек, в структуру таможни входят четыре таможенных поста, а регион деятельности включает Магаданскую область и Чукотский Автономный округ. Идя в ногу со временем, Магаданская таможня активно использует в своей работе перспективные таможенные технологии, направленные на ускорение и упрощение таможенного оформления и контроля. За 8 месяцев текущего года магаданские таможенники перечислили в федеральный бюджет больше миллиарда рублей, выполнив установленный плановый показатель на 103%, оформлено более 1,5 тысяч деклараций на товары, возбуждено 150 дел об административных правонарушениях и семь уголовных дел. Сумма представленных льгот по уплате таможенных платежей по товарам, задекларированным по процедуре свободной таможенной зоны (СТЗ), за 8 месяцев 2014 года уже составила более 530 млн рублей. Стоимостной объем товаров, задекларированных по процедуре СТЗ, в 2014 году составил 23 млн долларов США, весовой – 8 тысяч тонн. Для осуществления контроля за товарами и транспортными средствами, оформленными по процедуре свободной таможенной зоны с освобождением от уплаты таможенных платежей, круглосуточно действует постоянная зона таможенного контроля на границе ОЭЗ в Магаданской области.
